设为首页 |  加入收藏
首页首页 期刊简介 消息通知 编委会 电子期刊 投稿须知 广告合作 联系我们
新生儿缺血缺氧性脑病ceRNA调控网络构建分析

作者: 毕思童;侯礼轩;李丽华; 
单位:首都医科大学附属北京潞河医院
关键词: 新生儿;缺血缺氧性脑病;竞争性内源RNA;差异基因分析; 
分类号:
出版年·卷·期(页码):2024·43·4(361-369)
摘要:

目的 分析并构建新生儿缺血缺氧性脑病(hypoxic-ischemic encephalopathy, HIE)竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)的调控网络,筛选预测缺血缺氧性脑病诊治的潜在靶点。方法 通过TCGA和GEO数据库获取HIE的非编码RNA高通量测序数据,并进行差异基因分析。根据ceRNA理论构建出circRNA(circular RNA)-miRNA-mRNA网络,进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)信号通路和基因本体理论(Gene Ontology, GO)分享,探索和功能注释具有ceRNA潜在功能的circRNA。结果 对GSE121178数据集进行筛选,获得差异circRNAs165个,其中上调59个,下调106个;对GSE181127数据集进行筛选,获得差异miRNAs 63个,其中上调60个,下调3个。用miRecords、miRTarBase、TarBase数据库对获得差异miRNAs进行靶点mRNA预测,并对3个数据库预测结果取...

参考文献:

服务与反馈:
文章下载】【加入收藏
提示:您还未登录,请登录!点此登录
 
友情链接  
地址:北京安定门外安贞医院内北京生物医学工程编辑部
电话:010-64456508  传真:010-64456661
电子邮箱:llbl910219@126.com