医学图像配准在医学图像处理领域中已经被广泛使用.基于互信息配准的方法具有自动化程度高、配准精度高等优点.基于互信息的配准方法实质上是一种进行灰度统计和计算的方法,因此同一图像采用不同的灰度表示必然会影响配准结果.在分析灰度级别的压缩对于图像质量的影响和基于互信息配准方法的影响的基础上,进行了一系列的多模态医学图像配准试验,从配准精度和计算时间两个方面比较了不同的灰度级别对图像配准的影响.在详细分析和比较不同级别图像配准结果的基础上,给出了基于互信息配准时所采用的合理灰度级别的建议.