北京生物医学工程

基于压缩感知预测凋亡蛋白亚细胞位点

Prediction of apoptosis protein subcellular location based on compressive sensing

作者：石雪娜王瑞平

单位：                                 北京交通大学计算机与信息技术学院（北京100044）            

关键词：凋亡蛋白；亚细胞位点；压缩感

分类号：

出版年·卷·期（页码）：2015·34·1（70-71）

摘要：

目的蛋白质的亚细胞位点信息有助于了解蛋白质的功能，同时还可以

为新药物的研发提供帮助。方法在本研究中，采用压缩感知算法对凋亡蛋白

的亚细胞位点进行分类。结果经过在2个常用的数据集上使用Jackknife测试

，在ZD98数据集上取得了90.6%的预测准确率，在ZW225数据集上取得了87.3%的

准确率。结论实验结果表明压缩感知算法对已凋亡蛋白的亚细胞定位研究效

果良好，且避免了特征提取的过程。

Objective The information of protein subcellular location

helps us to understand protein function and to design new drugs.

Methods In this paper, compressive sensing algorithm is adopted to

classify protein subcellular location. Results By Jackknife test on

datasets, our overall accuracies for ZD98 and ZW225 are 90.6% and

87.3% respectively. Conclusions The effect of compressive sensing

algorithm is significant to classify apoptosis protein subcellular

location. And compressive sensing can avoid the process of feature

extraction.

参考文献：

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