设为首页 |  加入收藏
首页首页 期刊简介 消息通知 编委会 电子期刊 投稿须知 广告合作 联系我们
基于数据融合算法的精神分裂症易感基因排序及其信号通路研究

Gene ranking and signaling pathway of schizophrenia susceptible genes based on data fusion arithmetic

作者: 杨铠冰  冀燃  王美琴  张敏  张大保                          
单位:                                 首都医科大学生物医学工程学院(北京100069)            
关键词:                               精神分裂症易感基因;数据融合算法;基因排序;信号通路              
分类号:&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<br/>
出版年·卷·期(页码):2015·34·2(151-155)
摘要:

目的  利用已有的研究结果,采用数据融合分析方法,对与已知的精神分

裂症易感基因有密切关系的候选基因进行统计分析,得出基因排序及其信号通

路的结果,以此证明数据融合算法能够有效筛选精神分裂症易感基因。方法 根

据已知的与精神分裂症相关的基因,利用Endeavour工具,通过数据融合算法将

候选基因排序,并用DAVID数据库对基因排序结果进行功能注释和富集分析。结

果 利用数据融合算法获得的排序较高的基因与已有研究进行比较,证实排名第

二的NRG3和排名第三的AKT1与精神分裂症有密切联系。其他排名较高的基因可

以作为潜在的疾病易感基因,为精神分裂症的研究提供参考。结论 数据融合算

法能够准确评价候选基因与精神分裂症的联系,使用该方法能有效地对精神分

裂症易感基因进行筛选和判定。

Objective Based on previous studies, this paper applies

data fusion arithmetic to extract the potential susceptible genes and

signaling pathway related to schizophrenia, which proves that data

fusion algorithm is an effective method to filter schizophrenia

susceptible genes. Methods By making use of Endeavour tool which is

based on data fusion method, the candidate genes were ranked

according to their similarity with the training genes. Then DAVID

database was used to implement the functional annotation and

enrichment analysis for the extracted genes. Results Compared with

previous studies, the second NRG3 and third AKT1 which are obtained

from higher ranking candidate genes, are closely related to

schizophrenia. Other higher ranking genes could be used as potential

disease-susceptibility genes to provide reference for the research of

schizophrenia. Conclusions Data fusion arithmetic can help to detect

the potential schizophrenia candidate genes objectively and

correctly, and this method is a powerful tool for identifying

schizophrenia susceptible genes.

参考文献:

服务与反馈:
文章下载】【加入收藏
提示:您还未登录,请登录!点此登录
 
友情链接  
地址:北京安定门外安贞医院内北京生物医学工程编辑部
电话:010-64456508  传真:010-64456661
电子邮箱:llbl910219@126.com